175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0166 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  64.74 
 
 		 156 aa  217  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  56.64 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1580  putative polyketide cyclase / dehydrase  53.69 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  55.41 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  47.62 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  43.87 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  51.68 
 
 		 150 aa  147  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  51.68 
 
 		 150 aa  147  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  52 
 
 		 150 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  45.75 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  46.94 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  50.34 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  47.55 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3135  cyclase/dehydrase  45.62 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  46.67 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  46.67 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2585  cyclase/dehydrase  44.23 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  hitchhiker  0.00428625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1440  cyclase/dehydrase  43.87 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  45.64 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2887  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  45.33 
 
 		 152 aa  127  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  44.59 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  45.95 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  42.68 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0456  cyclase/dehydrase  42.65 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501936 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0280  hypothetical protein  42.65 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  39.07 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  41.22 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  47.01 
 
 		 136 aa  120  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1512  cyclase/dehydrase  42.28 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.530425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3898  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3970  cyclase/dehydrase  42.96 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.578911 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2053  cyclase/dehydrase  43.28 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  42.66 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  42.48 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2573  cyclase/dehydrase  38.96 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.720561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  39.26 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  38.73 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  42.76 
 
 		 152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  42.76 
 
 		 152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  40.14 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  38.03 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  39.44 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  39.44 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  39.44 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  38.73 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  40.14 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  41.48 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  39.26 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  40.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  38.73 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  38.73 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  39.44 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  38.73 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  39.44 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  39.44 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  38.73 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  38.73 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  38.73 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  39.26 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  38.73 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3368  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00867336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  38.73 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  38.73 
 
 		 144 aa  111  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  39.44 
 
 		 144 aa  111  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1240  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 145 aa  111  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.929537  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  39.26 
 
 		 145 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  39.26 
 
 		 145 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  39.26 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  38.19 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  39.26 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  38.73 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  38.73 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2341  cyclase/dehydrase  40.74 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  36.99 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  40.58 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  38.36 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  38.36 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  35.42 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  40.97 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1603  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  38.19 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  36.81 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1197  cyclase/dehydrase  35.42 
 
 		 146 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.35895 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>