173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2825 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  64.74 
 
 		 164 aa  217  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  55.56 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1580  putative polyketide cyclase / dehydrase  51.35 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  46.31 
 
 		 161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3135  cyclase/dehydrase  50.31 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  48.65 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  50.34 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  49.32 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  43.75 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  49.67 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  49.32 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  43.14 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  45.95 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  43.24 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  42.86 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  44.3 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  42.95 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  43.92 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  38.46 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  41.89 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  39.74 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  40.94 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  40.91 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2887  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  42.95 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  41.26 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  42.67 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  45.11 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0456  cyclase/dehydrase  38.36 
 
 		 161 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501936 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0280  hypothetical protein  38.36 
 
 		 161 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  38.03 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3898  cyclase/dehydrase  42.67 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514225 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1529  cyclase/dehydrase  42.66 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2585  cyclase/dehydrase  42.28 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  hitchhiker  0.00428625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  38.89 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  40.97 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  37.76 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  35.81 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6534  cyclase/dehydrase  40.94 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00656463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  35.81 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  35.92 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  37.06 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  37.06 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  37.06 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  37.06 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  37.32 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  37.06 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  37.06 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  37.06 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  37.06 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1408  cyclase/dehydrase  37.32 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  37.06 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  39.26 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  39.26 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1521  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351498  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1197  cyclase/dehydrase  35.42 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  36.62 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  38.52 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  36.99 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  35.37 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1440  cyclase/dehydrase  41.18 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1240  cyclase/dehydrase  37.32 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.929537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3368  cyclase/dehydrase  37.76 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00867336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  39.6 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0445  cyclase/dehydrase  36.81 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2573  cyclase/dehydrase  41.06 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.720561 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  36.62 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  38.03 
 
 		 158 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3051  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.247309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1335  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  39.26 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1308  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1299  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  39.26 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1283  cyclase/dehydrase  36.62 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106424  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  37.32 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  37.32 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  37.32 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  37.32 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  39.26 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1095  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157987  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  38.52 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  39.26 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  39.26 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  39.26 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  39.26 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  39.26 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5925  cyclase/dehydrase  37.58 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  38.52 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>