174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1876 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  56.64 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  54.73 
 
 		 148 aa  170  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  55.56 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  52 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  52 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1580  putative polyketide cyclase / dehydrase  50.68 
 
 		 171 aa  157  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  52 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  53.33 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  48.28 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3135  cyclase/dehydrase  49.33 
 
 		 161 aa  151  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485455 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  48.95 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  45.83 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  44.37 
 
 		 152 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  48.99 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  45.27 
 
 		 151 aa  139  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  45.58 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  43.92 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  42 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2887  cyclase/dehydrase  42.67 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2585  cyclase/dehydrase  44 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  hitchhiker  0.00428625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  42.38 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  42 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5925  cyclase/dehydrase  39.6 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  44 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  41.33 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  42.95 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  42.28 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  42.28 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0445  cyclase/dehydrase  40.28 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  40.69 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6534  cyclase/dehydrase  37.58 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00656463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3898  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2573  cyclase/dehydrase  40.27 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.720561 
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  44.36 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1440  cyclase/dehydrase  40.27 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1529  cyclase/dehydrase  41.04 
 
 		 185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0524  cyclase/dehydrase  37.58 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  36.05 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2750  cyclase/dehydrase  39.33 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  39.71 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1197  cyclase/dehydrase  36.99 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  36.3 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  39.16 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  36.3 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  36.3 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  36.3 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  36.3 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  36.3 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  35.56 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  36.3 
 
 		 145 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  38.46 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  35.86 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  35.42 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  35.86 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  35.86 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  35.86 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  35.86 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1512  cyclase/dehydrase  36.91 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.530425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  35.86 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  35.86 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  35.86 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  37.04 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  33.1 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  37.04 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  35.86 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1317  cyclase/dehydrase  37.8 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0865024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  34.27 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  37.31 
 
 		 145 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  37.31 
 
 		 145 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  34.81 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  35.42 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  36.3 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  34.72 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  35.21 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  35.56 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  35.21 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  34.93 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1425  hypothetical protein  36.57 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0213458  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1900  cyclase/dehydrase  38.58 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0473  hypothetical protein  34.75 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0246193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2018  cyclase/dehydrase  37.8 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  35.42 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  35.42 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  35.42 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  35.42 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2053  cyclase/dehydrase  36.03 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  35.42 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  32.39 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  34.07 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  31.69 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  33.57 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  32.64 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>