172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1440 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1440  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 155 aa  320  6e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  86.09 
 
 		 155 aa  273  7e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2887  cyclase/dehydrase  75.84 
 
 		 157 aa  243  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2585  cyclase/dehydrase  75.84 
 
 		 157 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  hitchhiker  0.00428625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  73.15 
 
 		 157 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2573  cyclase/dehydrase  71.14 
 
 		 158 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.720561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  71.14 
 
 		 157 aa  226  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3898  cyclase/dehydrase  66.44 
 
 		 152 aa  212  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  57.62 
 
 		 152 aa  197  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  58.28 
 
 		 152 aa  196  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  58.28 
 
 		 152 aa  196  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5925  cyclase/dehydrase  58.78 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  57.72 
 
 		 152 aa  190  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6534  cyclase/dehydrase  56.38 
 
 		 151 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00656463  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  56.67 
 
 		 151 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  55.92 
 
 		 152 aa  177  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1512  cyclase/dehydrase  54.3 
 
 		 152 aa  172  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.530425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  53.33 
 
 		 150 aa  170  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  50.66 
 
 		 153 aa  170  6.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  53.33 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  53.02 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  52.35 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  52.35 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  56.62 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0524  cyclase/dehydrase  53.69 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  46.31 
 
 		 148 aa  146  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  43.87 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  44.67 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  44.67 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  44 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3135  cyclase/dehydrase  44.97 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1580  putative polyketide cyclase / dehydrase  43.14 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  40.27 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  42.28 
 
 		 153 aa  124  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 		 149 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  41.18 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  40.27 
 
 		 161 aa  110  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0473  hypothetical protein  36.55 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0246193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2004  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0398865  normal  0.691542 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  33.56 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  33.57 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  35 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  35 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  35 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  34.29 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0553  hypothetical protein  35.25 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  34.29 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  32.89 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  35.21 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  35.21 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  34.29 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  32.86 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  34.97 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2750  cyclase/dehydrase  36.11 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  33.56 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  30.41 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1425  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0213458  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1454  polyketide cyclase/dehydrase family protein  33.77 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000012561  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  32.86 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1392  oligoketide cyclase/lipid transport protein  33.77 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000575207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  32.89 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0527  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3828  aromatic rich family protein  32.21 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  32.89 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1425  cyclase/dehydrase  31.43 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0445  cyclase/dehydrase  32.24 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  33.55 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  33.55 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0280  hypothetical protein  33.8 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1437  cyclase/dehydrase  35.37 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00296077  hitchhiker  0.00000517245 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0456  cyclase/dehydrase  33.8 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501936 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  33.56 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  33.11 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  31.08 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  31.08 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  31.08 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  32.43 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1529  cyclase/dehydrase  31.33 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  32.43 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  31.08 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  32.43 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  32.43 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  32.43 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  31.08 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  31.08 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  31.08 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1317  cyclase/dehydrase  31.85 
 
 		 129 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0865024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1740  cyclase/dehydrase  32.43 
 
 		 143 aa  85.5  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>