174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6534 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6534  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 151 aa  310  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00656463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5925  cyclase/dehydrase  90.07 
 
 		 151 aa  280  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  73.03 
 
 		 152 aa  229  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  73.83 
 
 		 152 aa  226  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  73.15 
 
 		 152 aa  225  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  73.83 
 
 		 152 aa  226  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  61.59 
 
 		 150 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3898  cyclase/dehydrase  61.07 
 
 		 152 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  56.08 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  59.73 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0524  cyclase/dehydrase  60.4 
 
 		 152 aa  178  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1512  cyclase/dehydrase  57.24 
 
 		 152 aa  177  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.530425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2573  cyclase/dehydrase  54.97 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.720561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1440  cyclase/dehydrase  56.38 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2887  cyclase/dehydrase  52.32 
 
 		 157 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  55.03 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  54.67 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  56.29 
 
 		 152 aa  171  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2585  cyclase/dehydrase  52.32 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  hitchhiker  0.00428625 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  55.33 
 
 		 151 aa  170  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  52.35 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  56.67 
 
 		 151 aa  166  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  52.67 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  54.36 
 
 		 149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  57.78 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3135  cyclase/dehydrase  44.3 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  40.94 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  40.94 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  39.6 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  38.93 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  42.76 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  37.58 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1580  putative polyketide cyclase / dehydrase  39.07 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  42.28 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  37.09 
 
 		 145 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  36.42 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  37.09 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  37.09 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  37.09 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  37.09 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  37.09 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  37.09 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  37.09 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  35.76 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1437  cyclase/dehydrase  42.34 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00296077  hitchhiker  0.00000517245 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  40.94 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  37.09 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  37.09 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  37.09 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  36.42 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  40.27 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  34.87 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  35.57 
 
 		 158 aa  103  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  35.57 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  35.57 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  35.57 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  35.57 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  35.57 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  35.57 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  35.57 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  34.87 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  35.57 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  34.87 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1425  cyclase/dehydrase  34.67 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  36.49 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  36.49 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  36.24 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  36.49 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0527  cyclase/dehydrase  34.67 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  36.49 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  36.49 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  35.76 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  32.89 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  36.24 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  32.05 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2018  cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  37.58 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1283  cyclase/dehydrase  38.51 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106424  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2004  cyclase/dehydrase  34.64 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0398865  normal  0.691542 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  35.97 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  35.1 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  36.91 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  38.26 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  38.26 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  38.26 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  38.26 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1240  cyclase/dehydrase  36.91 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.929537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  34.46 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1900  cyclase/dehydrase  37.04 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1521  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351498  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  32.89 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  35.1 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  33.11 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3005  cyclase/dehydrase  33.55 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1095  cyclase/dehydrase  36.49 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  37.33 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1408  cyclase/dehydrase  36.49 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>