174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3898 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3898  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 152 aa  309  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2887  cyclase/dehydrase  67.11 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  65.33 
 
 		 157 aa  216  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2573  cyclase/dehydrase  66.44 
 
 		 158 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.720561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2585  cyclase/dehydrase  66.44 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  hitchhiker  0.00428625 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  67.33 
 
 		 155 aa  214  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1440  cyclase/dehydrase  66.44 
 
 		 155 aa  199  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  63.76 
 
 		 157 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6534  cyclase/dehydrase  61.07 
 
 		 151 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00656463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  59.73 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  59.06 
 
 		 152 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  59.06 
 
 		 152 aa  183  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  59.06 
 
 		 152 aa  183  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5925  cyclase/dehydrase  59.73 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  58.67 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0524  cyclase/dehydrase  60.4 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  57.33 
 
 		 152 aa  178  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  56.95 
 
 		 150 aa  173  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  57.72 
 
 		 151 aa  173  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  56.29 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  56.38 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  52.29 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1512  cyclase/dehydrase  54.67 
 
 		 152 aa  168  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.530425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  54.36 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  58.21 
 
 		 136 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3135  cyclase/dehydrase  47.33 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485455 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  42.28 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  39.6 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  44 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  40.67 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  40.67 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1580  putative polyketide cyclase / dehydrase  38.93 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  40.4 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  42.67 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  38.57 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  39.29 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  39.29 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  39.29 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  38.26 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  35.95 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  37.86 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  37.86 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  37.86 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  37.86 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  37.86 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  37.86 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  37.86 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  36.43 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  36.18 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  37.86 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2004  cyclase/dehydrase  34.87 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0398865  normal  0.691542 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1900  cyclase/dehydrase  38.35 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2018  cyclase/dehydrase  39.1 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0527  cyclase/dehydrase  33.57 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0473  hypothetical protein  30.2 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0246193  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  35.53 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  35.53 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  37.16 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1425  cyclase/dehydrase  32.86 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2341  cyclase/dehydrase  35 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1755  hypothetical protein  38.57 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  31.54 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  35 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  33.55 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0553  hypothetical protein  30.99 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  34.21 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1437  cyclase/dehydrase  38.3 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00296077  hitchhiker  0.00000517245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3368  cyclase/dehydrase  35.25 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00867336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1317  cyclase/dehydrase  33.08 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0865024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  34 
 
 		 145 aa  87  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  33.81 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1529  cyclase/dehydrase  33.56 
 
 		 185 aa  87  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  34.06 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1740  cyclase/dehydrase  33.11 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  35.14 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  33.56 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2750  cyclase/dehydrase  35.21 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  32.43 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  32.43 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3902  cyclase/dehydrase  35.77 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670112 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  30.41 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1425  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0213458  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1454  polyketide cyclase/dehydrase family protein  33.77 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000012561  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1392  oligoketide cyclase/lipid transport protein  33.77 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000575207  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2058  cyclase/dehydrase  33.78 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00806179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  32.89 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  33.57 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  32.43 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2053  cyclase/dehydrase  34.75 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  35.14 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  33.09 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  33.56 
 
 		 146 aa  84.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>