173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1696 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  345  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  44.76 
 
 		 145 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  40.56 
 
 		 146 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1240  cyclase/dehydrase  45.07 
 
 		 145 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.929537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  43.66 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  41.55 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  40.97 
 
 		 146 aa  134  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  40.14 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3828  aromatic rich family protein  41.96 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1392  oligoketide cyclase/lipid transport protein  41.78 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000575207  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1454  polyketide cyclase/dehydrase family protein  41.78 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000012561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  42.66 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1529  cyclase/dehydrase  43.75 
 
 		 185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1197  cyclase/dehydrase  44.22 
 
 		 146 aa  131  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  41.89 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  42.66 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  41.22 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  42.66 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  41.26 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  41.26 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  41.38 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  39.86 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  39.86 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  39.86 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  40.97 
 
 		 145 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  39.86 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  41.55 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  41.55 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  41.55 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  39.86 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  42.25 
 
 		 145 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  41.55 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  40.97 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  40.97 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1335  cyclase/dehydrase  41.67 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  40.97 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3051  cyclase/dehydrase  41.67 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.247309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1308  cyclase/dehydrase  41.67 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1299  cyclase/dehydrase  41.67 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  40.85 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  39.58 
 
 		 145 aa  127  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1283  cyclase/dehydrase  40.85 
 
 		 143 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  40.28 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1408  cyclase/dehydrase  40.85 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1521  cyclase/dehydrase  40.28 
 
 		 145 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351498  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  39.58 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  39.58 
 
 		 144 aa  124  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1603  cyclase/dehydrase  37.76 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  38.89 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  39.29 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  39.29 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1740  cyclase/dehydrase  35.21 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2739  hypothetical protein  36.23 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000766301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  41.22 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  39.42 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  34.51 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1095  cyclase/dehydrase  38.73 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  37.14 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  39.16 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  37.14 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  40.28 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  37.14 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2053  cyclase/dehydrase  38.3 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  37.23 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  37.23 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  37.14 
 
 		 144 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  37.14 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  36.05 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  36.43 
 
 		 144 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  36.99 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  36.99 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  38.89 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  34.03 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  36.99 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1202  cyclase/dehydrase  35.86 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3368  cyclase/dehydrase  38.46 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00867336  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  34.03 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3902  cyclase/dehydrase  37.41 
 
 		 147 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  36 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3970  cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 143 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.578911 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  37.33 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  36.91 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  38.93 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  36.05 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  37.41 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  37.84 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  36.67 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>