174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1922 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  60.67 
 
 		 159 aa  201  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  62.5 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  48.61 
 
 		 147 aa  150  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  47.3 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  47.3 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  50.34 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  46.62 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  46 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3135  cyclase/dehydrase  43.79 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485455 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  43.14 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  46.26 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  44.67 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  44.3 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  44 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  46.31 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  42.21 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  46.31 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1580  putative polyketide cyclase / dehydrase  43.42 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  44.74 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2573  cyclase/dehydrase  45.64 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.720561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  47.65 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  42.11 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 		 151 aa  127  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  43.05 
 
 		 157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2585  cyclase/dehydrase  44.37 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  hitchhiker  0.00428625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2887  cyclase/dehydrase  43.71 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  44 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  44.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5925  cyclase/dehydrase  43.24 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6534  cyclase/dehydrase  42.28 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00656463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3898  cyclase/dehydrase  43.33 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  42.57 
 
 		 151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1512  cyclase/dehydrase  41.72 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.530425 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  38.26 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  44.78 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1440  cyclase/dehydrase  42.28 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0524  cyclase/dehydrase  40.67 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  38.03 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2750  cyclase/dehydrase  37.75 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  38.03 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  38.03 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  38.03 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  38.03 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  38.03 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1740  cyclase/dehydrase  33.8 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  33.79 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  34.93 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  36.62 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  35.42 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  33.79 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  33.11 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  34.72 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  35.92 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  36.11 
 
 		 145 aa  101  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1437  cyclase/dehydrase  37.34 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00296077  hitchhiker  0.00000517245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  34.72 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  36.11 
 
 		 145 aa  101  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  36.11 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  36.11 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  36.11 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  36.11 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  36.11 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  36.11 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  36.11 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1425  cyclase/dehydrase  32.87 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  33.56 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0527  cyclase/dehydrase  32.87 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3005  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  35.21 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2004  cyclase/dehydrase  33.11 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0398865  normal  0.691542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1095  cyclase/dehydrase  35.21 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  35.21 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  33.79 
 
 		 145 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  97.1  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1425  hypothetical protein  32.41 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0213458  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  33.57 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  31.47 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  35.66 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1202  cyclase/dehydrase  31.03 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  32.43 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  31.03 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1755  hypothetical protein  31.94 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1240  cyclase/dehydrase  35.21 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.929537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>