171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3135 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3135  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 161 aa  333  7e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  48.65 
 
 		 148 aa  157  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  53.02 
 
 		 150 aa  157  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  49.33 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  49.33 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  50 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  50.36 
 
 		 149 aa  153  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  49.33 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  46.62 
 
 		 151 aa  148  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  46.94 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  45.95 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3898  cyclase/dehydrase  47.33 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1580  putative polyketide cyclase / dehydrase  46.98 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  50.31 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  46 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  45.03 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2585  cyclase/dehydrase  48.59 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  hitchhiker  0.00428625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2887  cyclase/dehydrase  47.18 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  46.26 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  45.75 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  44.67 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  45.64 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  48.91 
 
 		 136 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2573  cyclase/dehydrase  46.98 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.720561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  44.97 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  42.95 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  43.79 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  45.62 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  43.4 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6534  cyclase/dehydrase  44.3 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00656463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5925  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1440  cyclase/dehydrase  44.97 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  43.33 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  43.33 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  42.96 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  42.67 
 
 		 152 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  41.22 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1512  cyclase/dehydrase  42.28 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.530425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0524  cyclase/dehydrase  41.22 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  39.57 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2750  cyclase/dehydrase  36.73 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  39.57 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  39.57 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  39.57 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  39.57 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  39.57 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  38.85 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  37.41 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  35.71 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  36.49 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  36.49 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  37.41 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3005  cyclase/dehydrase  34.27 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  36.69 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0445  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  36.69 
 
 		 145 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  36.69 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1317  cyclase/dehydrase  37.12 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0865024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  34.53 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  34 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  36.17 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2018  cyclase/dehydrase  38.64 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  36.88 
 
 		 145 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  36.88 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  36.88 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  36.88 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1900  cyclase/dehydrase  38.64 
 
 		 129 aa  97.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  36.88 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  36.88 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  36.88 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  36.88 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  36.88 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  35.71 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1425  cyclase/dehydrase  33.82 
 
 		 143 aa  97.4  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  35.46 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2053  cyclase/dehydrase  37.32 
 
 		 146 aa  97.1  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1197  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0527  cyclase/dehydrase  34.56 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  36.62 
 
 		 147 aa  95.5  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  36.96 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  36.23 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1425  hypothetical protein  35.14 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0213458  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  34.31 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  36.23 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  36.23 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  36.23 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1437  cyclase/dehydrase  36.03 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00296077  hitchhiker  0.00000517245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  32.37 
 
 		 144 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  33.11 
 
 		 144 aa  94  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  34.51 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  33.11 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  35.71 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  33.58 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  32.37 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0473  hypothetical protein  33.8 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0246193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2004  cyclase/dehydrase  35.21 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0398865  normal  0.691542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  34.51 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  30.94 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1202  cyclase/dehydrase  32.43 
 
 		 145 aa  92.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  34.04 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>