173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2053 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2053  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 146 aa  299  9e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  59.44 
 
 		 145 aa  191  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  52.82 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  52.11 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1197  cyclase/dehydrase  50 
 
 		 146 aa  153  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  51.41 
 
 		 144 aa  153  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  46.85 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  47.18 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  48.2 
 
 		 144 aa  146  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  45.14 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  47.18 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  47.48 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  47.48 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3970  cyclase/dehydrase  47.89 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.578911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  46.1 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  47.48 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  46.1 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3828  aromatic rich family protein  42.66 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1392  oligoketide cyclase/lipid transport protein  46.85 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000575207  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1454  polyketide cyclase/dehydrase family protein  46.85 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000012561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  46.04 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  46.04 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  46.04 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  46.04 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  42.86 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  43.17 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  45.32 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  44.37 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  44.37 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  44.37 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  44.37 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  44.37 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  44.37 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  44.37 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  44.37 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  44.68 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  46.04 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  44.37 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  45.71 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  48.63 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  44.6 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  43.06 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  46.43 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3368  cyclase/dehydrase  43.36 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00867336  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1529  cyclase/dehydrase  44.37 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  40.97 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1603  cyclase/dehydrase  42.96 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  40.97 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  43.06 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  39.58 
 
 		 144 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0280  hypothetical protein  46.43 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0456  cyclase/dehydrase  46.43 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  38.89 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  39.44 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  40.28 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  39.44 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  43.97 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  38.73 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  42.96 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1240  cyclase/dehydrase  41.73 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.929537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1740  cyclase/dehydrase  42.86 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  42.96 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  42.96 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  42.96 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  42.96 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  42.96 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  42.96 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  41.73 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  42.25 
 
 		 145 aa  127  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2739  hypothetical protein  39.01 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000766301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  42.14 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  42.25 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  42.25 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  42.96 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  39.29 
 
 		 175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  42.14 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  41.55 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2341  cyclase/dehydrase  40.56 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1425  hypothetical protein  40.71 
 
 		 145 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0213458  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  42.45 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  41.73 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  41.73 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  41.73 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  41.55 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  41.73 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  40.85 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1283  cyclase/dehydrase  41.01 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106424  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1095  cyclase/dehydrase  38.85 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  41.43 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3051  cyclase/dehydrase  41.73 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.247309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1308  cyclase/dehydrase  41.73 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1335  cyclase/dehydrase  41.73 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1299  cyclase/dehydrase  41.73 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1521  cyclase/dehydrase  41.01 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351498  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1408  cyclase/dehydrase  41.01 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2018  cyclase/dehydrase  44.09 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  39.44 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  43.28 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1900  cyclase/dehydrase  43.31 
 
 		 129 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  38.3 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>