43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2363 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2363  lipid-binding START domain-containing protein  100 
 
 		 247 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000024252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5284  lipid-binding START domain protein  29.86 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2486  lipid-binding START domain-containing protein  30.73 
 
 		 199 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.988768  normal  0.125317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001080  hypothetical protein  28.26 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2688  hypothetical protein  28.26 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0587  lipid-binding START domain protein  24.87 
 
 		 212 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2581  hypothetical protein  27.6 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.975236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2193  hypothetical protein  28.5 
 
 		 201 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2003  hypothetical protein  29.44 
 
 		 197 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2395  lipid-binding START domain-containing protein  29.44 
 
 		 199 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44080  hypothetical protein  26.37 
 
 		 202 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3748  hypothetical protein  26.37 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1496  cyclase/dehydrase  27.62 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0237206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2509  lipid-binding START domain-containing protein  27.84 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.802772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2242  lipid-binding START domain-containing protein  28.89 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3518  lipid-binding START domain-containing protein  28.86 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0217  lipid-binding START domain-containing protein  27.85 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3659  lipid-binding START domain protein  23.91 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0398378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3531  lipid-binding START domain protein  27.78 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1659  lipid-binding START domain-containing protein  27.86 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1318  hypothetical protein  25.37 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2718  hypothetical protein  27.72 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1609  hypothetical protein  25.59 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4109  hypothetical protein  27.17 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1011  cyclase/dehydrase  26.78 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.36244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3766  lipid-binding START domain-containing protein  27.59 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0812  hypothetical protein  24.73 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00891451  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3079  lipid-binding START domain-containing protein  26.96 
 
 		 346 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000582809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3105  hypothetical protein  21.59 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.112367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0962  hypothetical protein  25.54 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.267606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1528  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.116522  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1402  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0449379  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2500  hypothetical protein  24.62 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1288  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.406546  normal  0.754764 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1012  hypothetical protein  24.74 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0651821  normal  0.963461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1594  hypothetical protein  23.37 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1289  hypothetical protein  23.83 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.168956  normal  0.768265 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0963  hypothetical protein  23.44 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0932089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0811  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00425843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1495  hypothetical protein  21.84 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00358015  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1401  hypothetical protein  23.15 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00493081  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1527  hypothetical protein  21.94 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0659777  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2339  lipid-binding START domain-containing protein  22.11 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>