23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1843 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  214  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  42.72 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  47.57 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  42.2 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  41.82 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  41.82 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  41.82 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  41.82 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  42.99 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  42.99 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  52.5 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32156  predicted protein  44.16 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0990853  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  32.56 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  32.69 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2664  Polyketide cyclase/dehydrase  37.8 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  30.56 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  29.03 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  33 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  25.93 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  25.93 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  28.4 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>