19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32156 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_32156  predicted protein  100 
 
 
160 aa  330  4e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0990853  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  33.54 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  33.54 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  33.54 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  33.54 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  32.91 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  32.89 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  33.12 
 
 
185 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  29.05 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  29.11 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  44.16 
 
 
107 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  31.85 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  24.68 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  24.05 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  24.52 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  23.42 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  26.28 
 
 
162 aa  44.3  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  21.12 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  26.75 
 
 
146 aa  40.4  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>