44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2243 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  320  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  58.39 
 
 
154 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  55.86 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  48.3 
 
 
152 aa  150  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  50.34 
 
 
156 aa  147  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  47.68 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  42.48 
 
 
169 aa  143  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  48.28 
 
 
151 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  43.33 
 
 
155 aa  141  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  45.58 
 
 
157 aa  135  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  39.58 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  42 
 
 
154 aa  125  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  36.73 
 
 
167 aa  120  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  40 
 
 
169 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  42.38 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  38.51 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  37.67 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  38.93 
 
 
169 aa  93.6  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  38.18 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  39.13 
 
 
166 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  39.13 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 
501 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  28.37 
 
 
492 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  32.77 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  37.25 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  27.78 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  23.08 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  42.86 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  24.66 
 
 
155 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  28.21 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  30.77 
 
 
165 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  31.25 
 
 
209 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  30.23 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  29.03 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  22.07 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  28.57 
 
 
456 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  37.1 
 
 
462 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  24.31 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  30.23 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  26.67 
 
 
149 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>