48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0060 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  353  6.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  50.33 
 
 		 152 aa  164  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  48.08 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  49.02 
 
 		 155 aa  162  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  43.51 
 
 		 154 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  42.48 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  43.33 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  44.14 
 
 		 151 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  40.88 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  42.47 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  41.22 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  43.15 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  38.56 
 
 		 157 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  36.6 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  34.91 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  38.82 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  35.95 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 501 aa  97.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  38.46 
 
 		 153 aa  96.7  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  32.26 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  31.85 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  31.21 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  31.11 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  28.29 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  25.95 
 
 		 492 aa  63.9  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  32.26 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  27.81 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  37.04 
 
 		 462 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  27.61 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  27.97 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  31.11 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  33.68 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  29.85 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  27.49 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  35.06 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  32.97 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  26.19 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  27.71 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  31.63 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  22.63 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  23.33 
 
 		 456 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0188  hypothetical protein  26.45 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.478226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  29.76 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  27.07 
 
 		 149 aa  44.3  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>