45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12053 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  316  7e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  62.5 
 
 		 152 aa  203  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  59.31 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  49.02 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  48.32 
 
 		 167 aa  160  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  48.03 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  45.1 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  46.26 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  43.33 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  42.11 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  40.56 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  38.16 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  34.19 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  39.46 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  38.79 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  31.08 
 
 		 166 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  33.55 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  35.56 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 501 aa  84.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  33.82 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  29.94 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  26.92 
 
 		 492 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  35.56 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  28.46 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  31.76 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  26.35 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  26.92 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  27.95 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  28.28 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  28.92 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  25.4 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  30.38 
 
 		 209 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  33.77 
 
 		 462 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  26.02 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  25.78 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  28.95 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  26.83 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  22.54 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>