29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3727 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  327  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  55.7 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  44.52 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  39.74 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  41.33 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  41.27 
 
 		 209 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  37.5 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  36.22 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  34.25 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  30.65 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 501 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  32.97 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  29.52 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  25.53 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  28.05 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  26.09 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  29.51 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  26.97 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  23.77 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  26.02 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  25.29 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  27.48 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  33.77 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  30.43 
 
 		 456 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  27.54 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  32.89 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  23.02 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>