49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0999 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 157 aa  328  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  72.08 
 
 		 154 aa  240  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  56.58 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  50.32 
 
 		 158 aa  170  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  47.22 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  45.33 
 
 		 151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  43.92 
 
 		 167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  45.58 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  52.1 
 
 		 123 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  43.36 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  38.56 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  43.48 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  42.55 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  38.06 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  40.29 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  38.73 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.73 
 
 		 501 aa  90.5  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  37.41 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  35.14 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  31.82 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  31.82 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  30.4 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  35.58 
 
 		 209 aa  67.4  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  30.36 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  29.71 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  29.41 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  28.06 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  37.97 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  34.48 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  30.41 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  27.56 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  28.22 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  30.19 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  27.01 
 
 		 492 aa  54.3  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  30 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  25.93 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  26.67 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  28.06 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  25 
 
 		 462 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  27.08 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  30.23 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  27.48 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  29.63 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  30.26 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04550  cyclase/dehydrase ; Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.77 
 
 		 532 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  25 
 
 		 456 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>