30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3771 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  41.78 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  39.6 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  43.75 
 
 		 209 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  34.25 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  38.03 
 
 		 151 aa  87.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  40.88 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  35.53 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  33.56 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  34.75 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 		 501 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  28.91 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  34.41 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  27.27 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  32.63 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  28.92 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  22.63 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  26.37 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  29.29 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  27.85 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  29.2 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  29.17 
 
 		 462 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  45.07 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  25 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  31.54 
 
 		 176 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  33.33 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>