42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1518 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  55.88 
 
 		 165 aa  187  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  56.71 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  52.66 
 
 		 176 aa  170  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  51.5 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  32.7 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  31.25 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  29.94 
 
 		 155 aa  72  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  31.93 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  30.63 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  32.9 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  30 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  31.93 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  27.81 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  28.12 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  28.48 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  29.23 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  28.4 
 
 		 492 aa  61.6  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  28.31 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  29.38 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  31.88 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  31.29 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  29.38 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  29.3 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  26.32 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  27.63 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  29.3 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  30.95 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  29.22 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  30 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 		 501 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  28.3 
 
 		 462 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  29.08 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  31.16 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  26.71 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  27.39 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  28.92 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  29.29 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  45.45 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  30.48 
 
 		 123 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>