45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3113 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  100 
 
 
159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  60.12 
 
 
163 aa  192  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  56.97 
 
 
165 aa  189  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  56.71 
 
 
165 aa  177  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  52.15 
 
 
176 aa  167  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  36.88 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  29.94 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  32.5 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  29.94 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  34.38 
 
 
492 aa  71.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  28.93 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  30.63 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  29.81 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  29.19 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  28.29 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  29.41 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  32.48 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  28.76 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  28.29 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
501 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  31.97 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  28.85 
 
 
167 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  26.75 
 
 
158 aa  57.8  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  27.95 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  29.81 
 
 
169 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  31.47 
 
 
169 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  28.97 
 
 
156 aa  53.9  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  26.77 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  26.67 
 
 
157 aa  52  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  28.08 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  26.62 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  25.58 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04550  cyclase/dehydrase ; Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.17 
 
 
532 aa  47.8  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11471  hypothetical protein  26.45 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.361197  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  29.03 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  33.66 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  34.15 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  25.48 
 
 
462 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  26.62 
 
 
453 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4801  Polyketide cyclase/dehydrase  30 
 
 
170 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  41.67 
 
 
166 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  42.22 
 
 
161 aa  40.4  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  25.97 
 
 
449 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>