22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4801 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4801  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
170 aa  343  5e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  42 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  36.89 
 
 
155 aa  62.4  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  28.89 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
501 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  32.12 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  35.87 
 
 
166 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  31.97 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  27.61 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  35.19 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  25.77 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  29.41 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  25.5 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 
149 aa  42  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  30 
 
 
159 aa  42  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  29.41 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  26.67 
 
 
154 aa  41.2  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  27.84 
 
 
462 aa  40.8  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  31.07 
 
 
152 aa  40.8  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  23.4 
 
 
151 aa  40.8  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  28.12 
 
 
155 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  32.14 
 
 
161 aa  40.4  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>