45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1520 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  253  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  60.36 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  52.1 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  53.45 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  41.75 
 
 
167 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  43.97 
 
 
169 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  42.72 
 
 
152 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  37.93 
 
 
156 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  40.78 
 
 
151 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  38.79 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  37.04 
 
 
169 aa  93.6  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  38.18 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  39.62 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  40.74 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  37.25 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  30.17 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  37.37 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  32.17 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  33.63 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  29.66 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  30.89 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 
501 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  35.71 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  30.1 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  35.29 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  34.69 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  31.43 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  32.93 
 
 
462 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  34.12 
 
 
180 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  29.87 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  27.85 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  38.71 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  27.97 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  36.76 
 
 
492 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  23.6 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  31.71 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4801  Polyketide cyclase/dehydrase  25.77 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  27.85 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  27.54 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  30.48 
 
 
165 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>