42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2813 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  333  5.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  71.72 
 
 
209 aa  211  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  50.71 
 
 
151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  49.29 
 
 
161 aa  124  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  38.97 
 
 
155 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  36.22 
 
 
156 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  39.6 
 
 
151 aa  95.5  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  39.57 
 
 
180 aa  94.4  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  36.29 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  37.5 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  32.5 
 
 
169 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
501 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  36.71 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  31.71 
 
 
152 aa  57.8  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  30.95 
 
 
151 aa  57.4  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  34.21 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  30.19 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  35.62 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  33.67 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  35.06 
 
 
169 aa  54.7  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  30.43 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  32.39 
 
 
153 aa  54.3  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  33.33 
 
 
153 aa  54.3  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  29.87 
 
 
123 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4801  Polyketide cyclase/dehydrase  35.87 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  34.55 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  29.29 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  31.01 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  25.89 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  30.7 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  31.03 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  30.21 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  25 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  30.13 
 
 
456 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  29.89 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  28.95 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  32.93 
 
 
154 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  30.95 
 
 
462 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  41.67 
 
 
159 aa  41.6  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  30.23 
 
 
153 aa  41.2  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>