48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0897 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  325  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  54.67 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  48.08 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  49.66 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  48.03 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  48.67 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  47.68 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  47.06 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  42.67 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  42.86 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  48 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  42.38 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  38.56 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  39.46 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  41.45 
 
 		 166 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.45 
 
 		 501 aa  117  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  35.95 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  39.1 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  39.35 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  37.93 
 
 		 123 aa  101  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  38.26 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  40.44 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  28.47 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  28.38 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  27.7 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  27.4 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  27.54 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  28.99 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  37.04 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  33.7 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  36.9 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  29.05 
 
 		 492 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  31.29 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  27.7 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  29.1 
 
 		 462 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  38.3 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  23.81 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  36.17 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  35.62 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  28.97 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  28.79 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  25.16 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  29.33 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  25.32 
 
 		 449 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  25.29 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  23.15 
 
 		 456 aa  41.6  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>