26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1021 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1021  cyclase/dehydrase  100 
 
 
144 aa  289  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5816  cyclase/dehydrase  84.03 
 
 
144 aa  249  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0214868  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2872  hypothetical protein  76.22 
 
 
144 aa  229  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2916  cyclase/dehydrase  76.22 
 
 
144 aa  229  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790251  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2902  cyclase/dehydrase  76.22 
 
 
144 aa  229  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 
242 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  27.92 
 
 
243 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  26.39 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1409  cyclase/dehydrase  27.35 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1315  Polyketide cyclase/dehydrase  27.13 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 
144 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  22.52 
 
 
232 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1738  cyclase/dehydrase  26.57 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.265595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  28.67 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  27.05 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  25.83 
 
 
238 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1645  bacterio-opsin linked product  26.67 
 
 
166 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  28.38 
 
 
244 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2531  hypothetical protein  26.42 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0544904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  27.33 
 
 
272 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3139  hypothetical protein  23.49 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376629  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  29.92 
 
 
198 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  25.87 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  22.38 
 
 
150 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3264  cyclase/dehydrase  31.67 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  25.81 
 
 
192 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>