14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1315 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1315  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 		 144 aa  294  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2654  cyclase/dehydrase  23.45 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  29.84 
 
 		 284 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1021  cyclase/dehydrase  27.13 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  31.62 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2872  hypothetical protein  26.79 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2916  cyclase/dehydrase  26.79 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2902  cyclase/dehydrase  26.79 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  31.62 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  23.81 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  27.74 
 
 		 256 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  27.43 
 
 		 214 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 		 225 aa  40.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>