22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5816 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5816  cyclase/dehydrase  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0214868  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1021  cyclase/dehydrase  84.03 
 
 
144 aa  249  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2872  hypothetical protein  74.83 
 
 
144 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2916  cyclase/dehydrase  74.83 
 
 
144 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790251  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2902  cyclase/dehydrase  74.83 
 
 
144 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  26.85 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1645  bacterio-opsin linked product  27.08 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  27.87 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  23.78 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2739  hypothetical protein  22.79 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000766301  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  23.65 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  25.97 
 
 
242 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  26.9 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3139  hypothetical protein  24 
 
 
142 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376629  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  27.59 
 
 
141 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  25.32 
 
 
243 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1459  hypothetical protein  32.67 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3264  cyclase/dehydrase  31.03 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  26.11 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  23.68 
 
 
192 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>