10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1118 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1118  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  417  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392266  normal  0.775853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4620  hypothetical protein  58.68 
 
 
231 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  33.98 
 
 
151 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0424  Hsp90 ATPase activator family protein  31.48 
 
 
163 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49026  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  27.5 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  27.5 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  27.5 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  31.78 
 
 
185 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  30.85 
 
 
141 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.48 
 
 
150 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>