11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6684 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6684  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  317  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.919976  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3264  cyclase/dehydrase  46.31 
 
 
140 aa  140  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  35.22 
 
 
151 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  35.76 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3391  hypothetical protein  29.2 
 
 
128 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  27.7 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  28.57 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  23.18 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  26.32 
 
 
150 aa  41.2  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.54 
 
 
139 aa  40.8  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.548712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  27.34 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>