10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3328 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3328  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  345  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311727  hitchhiker  0.00221745 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3746  hypothetical protein  65.77 
 
 		 176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5489  hypothetical protein  51.66 
 
 		 159 aa  147  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  49.68 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  35.77 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  26.36 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  27.46 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  26.21 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  34.21 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  38.27 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>