156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2096 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  721    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  721    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  71.43 
 
 		 370 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  71.59 
 
 		 377 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  67.85 
 
 		 372 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.03 
 
 		 371 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  67.92 
 
 		 366 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  70.86 
 
 		 372 aa  421  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  63.24 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  46.79 
 
 		 563 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  44.05 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  46.03 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.16 
 
 		 575 aa  249  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 583 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.66 
 
 		 583 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.69 
 
 		 579 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  42.86 
 
 		 564 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.52 
 
 		 579 aa  223  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.32 
 
 		 579 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.34 
 
 		 575 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.61 
 
 		 573 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  39.69 
 
 		 581 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.73 
 
 		 573 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  40.18 
 
 		 544 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.36 
 
 		 569 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  37.64 
 
 		 575 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.16 
 
 		 575 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.82 
 
 		 551 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  25.56 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1501  component of copper transport system  24.7 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252405  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.07 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 504 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  29.82 
 
 		 524 aa  67.8  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  31.69 
 
 		 525 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 527 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.16 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.62 
 
 		 627 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  24.09 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  29.37 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  29.7 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.64 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  29.7 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.42 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  25.06 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5136  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.14 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  27.19 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  29.5 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.99 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.75 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 		 421 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  25.27 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.03 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 		 568 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  26.71 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5682  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein NimB  30.16 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00246104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.09 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  24.72 
 
 		 504 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.16 
 
 		 607 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 553 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  26.55 
 
 		 737 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.36 
 
 		 564 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  28.64 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  23.12 
 
 		 472 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5654  secretion protein HlyD  28.7 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  27.87 
 
 		 391 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  25.27 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.4 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  28.01 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.24 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1239  RND family efflux transporter MFP subunit  27.08 
 
 		 451 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  26.43 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  28.27 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.65 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.22 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50904  normal  0.396278 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4376  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.22 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  27.82 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 		 460 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  26.12 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  23.15 
 
 		 529 aa  50.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  25.29 
 
 		 500 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.74 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  28.64 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.66 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  25.32 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  26.57 
 
 		 625 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1988  RND family efflux transporter MFP subunit  25.09 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  31.77 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  26.04 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.51 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.99 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>