More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2704 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  100 
 
 		 898 aa  1821    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  33.6 
 
 		 905 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  30.33 
 
 		 764 aa  214  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  24.27 
 
 		 872 aa  168  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  21.51 
 
 		 865 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  21.05 
 
 		 877 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.61 
 
 		 778 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.68 
 
 		 1051 aa  149  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  28.5 
 
 		 861 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  19.93 
 
 		 881 aa  144  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.28 
 
 		 807 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  26.25 
 
 		 767 aa  130  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  23.42 
 
 		 755 aa  129  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  22.9 
 
 		 815 aa  128  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  21.88 
 
 		 799 aa  122  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.35 
 
 		 837 aa  121  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  23.2 
 
 		 791 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  23.51 
 
 		 792 aa  117  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1083 aa  114  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  27.8 
 
 		 797 aa  111  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  28.47 
 
 		 796 aa  111  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  22.87 
 
 		 821 aa  110  9.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  24.43 
 
 		 807 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  25.58 
 
 		 869 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  25.32 
 
 		 869 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  23.35 
 
 		 823 aa  105  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  22.75 
 
 		 823 aa  104  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  22.09 
 
 		 779 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.77 
 
 		 764 aa  103  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  28.92 
 
 		 790 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.75 
 
 		 800 aa  101  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  23.37 
 
 		 816 aa  101  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  26.03 
 
 		 801 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  22.4 
 
 		 823 aa  100  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  21.45 
 
 		 808 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  22.46 
 
 		 824 aa  99.4  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  24.47 
 
 		 830 aa  97.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.4 
 
 		 808 aa  97.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  29.08 
 
 		 727 aa  95.9  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.14 
 
 		 779 aa  94.7  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  21.96 
 
 		 786 aa  94.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  24.44 
 
 		 813 aa  94.7  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.1 
 
 		 811 aa  94.4  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.14 
 
 		 967 aa  94.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  23.24 
 
 		 860 aa  93.6  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  32.29 
 
 		 694 aa  93.2  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  26.18 
 
 		 787 aa  92.8  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  26.77 
 
 		 835 aa  91.7  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.1 
 
 		 788 aa  91.3  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  28.46 
 
 		 828 aa  90.1  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22 
 
 		 831 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  20.8 
 
 		 815 aa  89  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  20.97 
 
 		 765 aa  87.8  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  31.07 
 
 		 694 aa  87.8  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  20.92 
 
 		 751 aa  87.8  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.56 
 
 		 806 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  23.35 
 
 		 821 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  19.55 
 
 		 803 aa  86.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  28.33 
 
 		 874 aa  86.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  24.63 
 
 		 859 aa  85.9  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  21.12 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  26.73 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  21.76 
 
 		 756 aa  84.7  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.71 
 
 		 804 aa  84  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  26.38 
 
 		 799 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  21.16 
 
 		 385 aa  83.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  26.7 
 
 		 825 aa  83.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  26.38 
 
 		 799 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  26.38 
 
 		 799 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  26.51 
 
 		 795 aa  82.8  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  21.48 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  24.86 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.33 
 
 		 792 aa  82.4  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  20.63 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  22.94 
 
 		 789 aa  81.6  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  20.65 
 
 		 771 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  20.88 
 
 		 778 aa  82  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  26.34 
 
 		 799 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  21.18 
 
 		 804 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  22.2 
 
 		 794 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  22.74 
 
 		 692 aa  80.5  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  28.63 
 
 		 1359 aa  79.7  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  21.88 
 
 		 799 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  20.45 
 
 		 806 aa  79.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  20.15 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  20.53 
 
 		 786 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  21.93 
 
 		 786 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.73 
 
 		 800 aa  78.2  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  26.39 
 
 		 669 aa  78.2  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  19.7 
 
 		 767 aa  77  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  20.36 
 
 		 786 aa  77  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  20.36 
 
 		 786 aa  77  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  29.59 
 
 		 776 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  19.85 
 
 		 771 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  20.22 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  19.85 
 
 		 771 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  21.78 
 
 		 763 aa  75.5  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  20.33 
 
 		 786 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.83 
 
 		 773 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  21.6 
 
 		 805 aa  74.7  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>