More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0115 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0115  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 579 aa  1161    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  30.78 
 
 		 578 aa  210  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 574 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.14 
 
 		 689 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.44 
 
 		 3145 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32 
 
 		 577 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 542 aa  191  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1450 aa  189  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 1038 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 523 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 760 aa  187  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 688 aa  187  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  30.85 
 
 		 648 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 1827 aa  183  9.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.04 
 
 		 714 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 714 aa  176  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  28.09 
 
 		 703 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.19 
 
 		 872 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  28.57 
 
 		 1077 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.68 
 
 		 1034 aa  170  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 601 aa  170  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 662 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 529 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 602 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 472 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 649 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  31.24 
 
 		 540 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 649 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1005 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.72 
 
 		 626 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 		 527 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.56 
 
 		 1764 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 740 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  29.44 
 
 		 473 aa  163  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.36 
 
 		 1677 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 767 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 780 aa  159  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 646 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 747 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.81 
 
 		 620 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.64 
 
 		 626 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 620 aa  158  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 614 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.64 
 
 		 614 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 637 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 614 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.64 
 
 		 614 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 546 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 608 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.43 
 
 		 626 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  27.33 
 
 		 653 aa  156  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 747 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 653 aa  156  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 614 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  29.38 
 
 		 615 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 505 aa  154  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 615 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 502 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 681 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 573 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 1073 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.1 
 
 		 603 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 520 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 496 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 502 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  29.06 
 
 		 502 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  26.76 
 
 		 600 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 923 aa  143  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 592 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 611 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  30.44 
 
 		 545 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 583 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 635 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 635 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 571 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 955 aa  140  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 935 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  27.78 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 595 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 595 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 593 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 611 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 1212 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.67 
 
 		 545 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 637 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 639 aa  135  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 607 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  27.5 
 
 		 503 aa  134  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 612 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 559 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 484 aa  127  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>