265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0443 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0443  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 280 aa  64.3  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 		 699 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  43 
 
 		 795 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  28.28 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  27.78 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 512 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  30.6 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 589 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 866 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 		 602 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 824 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1276 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 879 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 927 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 637 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 607 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  33.82 
 
 		 732 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  30.91 
 
 		 395 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.5 
 
 		 622 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 740 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 361 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.69 
 
 		 784 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.21 
 
 		 563 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 3035 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.47 
 
 		 561 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.13 
 
 		 1013 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.93 
 
 		 545 aa  52  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.11 
 
 		 764 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 649 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 649 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 626 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 573 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 1094 aa  51.2  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 618 aa  51.2  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 1827 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.6 
 
 		 265 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 573 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 4489 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 543 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  26.92 
 
 		 832 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  27.19 
 
 		 955 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.47 
 
 		 561 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 344 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.32 
 
 		 599 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 681 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 471 aa  50.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1274 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.85 
 
 		 2240 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.81 
 
 		 1154 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 		 1034 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 608 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 583 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  26.47 
 
 		 889 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 435 aa  48.9  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 377 aa  48.9  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.89 
 
 		 1737 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 708 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 624 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 		 3301 aa  48.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 1252 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  23.48 
 
 		 695 aa  48.5  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 1252 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 4079 aa  48.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 330 aa  48.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 646 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.44 
 
 		 397 aa  48.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.02 
 
 		 292 aa  48.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 643 aa  48.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 3172 aa  48.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 3560 aa  48.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 472 aa  48.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 245 aa  48.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  33.33 
 
 		 573 aa  48.1  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 499 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0681  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 549 aa  48.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.607702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 542 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  34 
 
 		 573 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.43 
 
 		 589 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 750 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1213  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 		 833 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  25.93 
 
 		 390 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 		 415 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.24 
 
 		 1694 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0213  TPR domain-containing protein  27.97 
 
 		 380 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000856086  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1676 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 520 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  23.81 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.01 
 
 		 546 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  27.05 
 
 		 714 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  31.37 
 
 		 584 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>