216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0213 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0213  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 380 aa  761    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000856086  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.37 
 
 		 810 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0226  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 632 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 878 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 739 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  32.58 
 
 		 795 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 3301 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  30.23 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 927 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 909 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.23 
 
 		 587 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 4079 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.37 
 
 		 1737 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 3172 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.53 
 
 		 2401 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 685 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0100  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.2 
 
 		 1979 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 543 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.11 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.99 
 
 		 818 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.86 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 3145 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.37 
 
 		 784 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 750 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  29.8 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 311 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 		 2240 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 217 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 750 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.99 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  32.14 
 
 		 865 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 824 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  31.01 
 
 		 864 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  31.3 
 
 		 732 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  36.27 
 
 		 272 aa  53.1  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 700 aa  52.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1276 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  31.76 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.53 
 
 		 780 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 583 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.57 
 
 		 1056 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.66 
 
 		 1694 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.5 
 
 		 875 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1069 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  28.68 
 
 		 682 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  33.98 
 
 		 603 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.34 
 
 		 572 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 804 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 542 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1184  TPR domain-containing protein  31.01 
 
 		 222 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 505 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06745  TPR repeat protein  26.16 
 
 		 463 aa  50.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.88 
 
 		 887 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 602 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  25.14 
 
 		 585 aa  49.7  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 687 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 612 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 		 758 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.14 
 
 		 623 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 836 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.32 
 
 		 730 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.52 
 
 		 1034 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.4 
 
 		 572 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1714 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 1005 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  32.09 
 
 		 653 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 808 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 790 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 1252 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 		 602 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 3035 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 762 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  26.58 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 1252 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 653 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  26.83 
 
 		 572 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 670 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 572 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 860 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 708 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 1421 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 3560 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  34.21 
 
 		 992 aa  47.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 245 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>