More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1340 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1340  Outer membrane protein and related peptidoglycan- associated (lipo)protein-like protein  100 
 
 		 535 aa  1079    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.52 
 
 		 356 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  47.37 
 
 		 193 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  41.27 
 
 		 223 aa  89.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  37.34 
 
 		 560 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  42.02 
 
 		 218 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  41.12 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.69 
 
 		 521 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  40.16 
 
 		 228 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.84 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 224 aa  82.4  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  42.06 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  39.52 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  40.16 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  37.8 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1203  OmpA/MotB domain-containing protein  40.85 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.232705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  39.37 
 
 		 176 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 		 229 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  38.79 
 
 		 217 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 		 217 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.47 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  38.02 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.45 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.71 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 296 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 229 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  35.34 
 
 		 224 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.7 
 
 		 427 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  37.29 
 
 		 233 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  39.13 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  42.02 
 
 		 222 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  41.46 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  39.37 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  37.04 
 
 		 648 aa  75.1  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  38.79 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  37.19 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.13 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  35.42 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  32.67 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.62 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  33.33 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  32.32 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40.57 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  37.84 
 
 		 694 aa  73.6  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40.57 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 623 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 642 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.13 
 
 		 542 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 215 aa  73.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 360 aa  73.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 		 543 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 261 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  34.96 
 
 		 252 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 		 225 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 220 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 224 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  34.62 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 217 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 230 aa  72  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  42.02 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.85 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  38.68 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  38.68 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  33.86 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  36.92 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  38.68 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.68 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  38.21 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  38.21 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  30.69 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  35.54 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  38.53 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>