More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4088 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  51.77 
 
 		 677 aa  684    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 650 aa  1336    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  95.69 
 
 		 649 aa  1249    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  56.2 
 
 		 729 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  54.43 
 
 		 741 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  56.06 
 
 		 707 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  56.06 
 
 		 737 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  55.77 
 
 		 767 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  56.06 
 
 		 749 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  50.27 
 
 		 735 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 651 aa  335  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 665 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 669 aa  279  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 699 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  41.24 
 
 		 695 aa  203  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.85 
 
 		 653 aa  151  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 654 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 678 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 656 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 657 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 627 aa  107  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  22.86 
 
 		 615 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  20.56 
 
 		 693 aa  95.1  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 619 aa  95.1  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 593 aa  94  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 744 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1228  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 623 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0002097  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 697 aa  92  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  22.4 
 
 		 617 aa  91.3  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 668 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 634 aa  89.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 708 aa  87.4  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 649 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 659 aa  84  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 667 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 665 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 683 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 703 aa  80.9  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 597 aa  80.9  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 710 aa  80.9  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 673 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 656 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  23.42 
 
 		 656 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 618 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  21.44 
 
 		 663 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  37.5 
 
 		 651 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.92 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  32.89 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.91 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 605 aa  77.8  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  30.37 
 
 		 671 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 613 aa  77.8  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  28.36 
 
 		 636 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.49 
 
 		 616 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  31.4 
 
 		 631 aa  77  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  23.59 
 
 		 655 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 		 710 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 686 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 1128 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 627 aa  76.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0653  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 675 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  21.08 
 
 		 688 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 643 aa  75.1  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 635 aa  75.1  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  31.65 
 
 		 739 aa  74.7  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 694 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  22.2 
 
 		 571 aa  74.3  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 626 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  30.06 
 
 		 936 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 617 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 697 aa  72  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 628 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 685 aa  72  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  33.82 
 
 		 620 aa  71.6  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 675 aa  71.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 682 aa  71.2  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  28.17 
 
 		 690 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  21.96 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  30.05 
 
 		 746 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  30.05 
 
 		 746 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  30.05 
 
 		 746 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  30.05 
 
 		 746 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  38.66 
 
 		 627 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  30.05 
 
 		 746 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 		 726 aa  70.5  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  30.05 
 
 		 746 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  30.05 
 
 		 746 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 		 726 aa  70.5  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 746 aa  70.5  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  30.05 
 
 		 746 aa  70.5  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  25.71 
 
 		 613 aa  70.5  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 692 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.74 
 
 		 675 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  29.1 
 
 		 646 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 634 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 634 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  26.14 
 
 		 656 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  32.33 
 
 		 680 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  30.72 
 
 		 661 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>