More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4394 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 575 aa  1173    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  61.57 
 
 		 567 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  53.63 
 
 		 528 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  40.11 
 
 		 544 aa  410  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  42.65 
 
 		 535 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  40.64 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  42.15 
 
 		 525 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  42.42 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  39.23 
 
 		 556 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  37.95 
 
 		 549 aa  345  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  37.17 
 
 		 560 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  37.16 
 
 		 555 aa  333  6e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  37.29 
 
 		 556 aa  332  9e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  37.76 
 
 		 551 aa  327  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  38.12 
 
 		 535 aa  327  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  36.13 
 
 		 551 aa  325  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  36.83 
 
 		 552 aa  325  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  36.86 
 
 		 547 aa  322  8e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  40.45 
 
 		 526 aa  319  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  37.72 
 
 		 544 aa  313  4.999999999999999e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  34.18 
 
 		 538 aa  276  9e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  36.78 
 
 		 550 aa  258  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  42.45 
 
 		 450 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  37.77 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  40.86 
 
 		 443 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  40.51 
 
 		 455 aa  243  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  37.66 
 
 		 540 aa  242  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  42.22 
 
 		 443 aa  241  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  40.63 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  41.14 
 
 		 457 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  38.04 
 
 		 444 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  40.32 
 
 		 439 aa  236  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 		 444 aa  236  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  41.9 
 
 		 452 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  38.13 
 
 		 545 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  37.63 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  41 
 
 		 455 aa  233  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  39.02 
 
 		 444 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  40.86 
 
 		 461 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  41.19 
 
 		 458 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  39.89 
 
 		 444 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  39.3 
 
 		 426 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.86 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  39.2 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  37.01 
 
 		 441 aa  228  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  36.87 
 
 		 440 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  38.1 
 
 		 432 aa  226  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  39.49 
 
 		 429 aa  224  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  36.31 
 
 		 439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  39.69 
 
 		 468 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  40.67 
 
 		 441 aa  223  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  33.79 
 
 		 557 aa  223  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 433 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  36.68 
 
 		 459 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  38.68 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 		 410 aa  221  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  39.56 
 
 		 482 aa  220  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  39.56 
 
 		 482 aa  220  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  37.91 
 
 		 443 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  31.77 
 
 		 550 aa  219  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  38.3 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 		 446 aa  219  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 		 440 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  36.86 
 
 		 476 aa  217  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 		 440 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  37.81 
 
 		 423 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.56 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.44 
 
 		 423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  34.08 
 
 		 422 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  39.37 
 
 		 445 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  35.82 
 
 		 478 aa  213  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  37.77 
 
 		 457 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  37.16 
 
 		 468 aa  213  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  39.37 
 
 		 445 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  35.57 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  36.94 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  35.48 
 
 		 441 aa  210  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  38.6 
 
 		 483 aa  210  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  37.42 
 
 		 437 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  36.97 
 
 		 481 aa  209  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  36.97 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  37.34 
 
 		 439 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  37.42 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  37.25 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  38.56 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  38.56 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  36.07 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  38.42 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  38.82 
 
 		 453 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  37.71 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  35.75 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  38.53 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  36.5 
 
 		 456 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  35.84 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  37.08 
 
 		 480 aa  207  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  34.2 
 
 		 435 aa  207  6e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  33.99 
 
 		 439 aa  206  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  38.34 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>