More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2170 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.67 
 
 		 500 aa  648    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.802205  normal  0.183546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2083  methyl-accepting chemotaxis protein  88.71 
 
 		 505 aa  911    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.15 
 
 		 502 aa  869    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00626539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.99 
 
 		 506 aa  868    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00117287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.79 
 
 		 506 aa  866    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0204582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1899  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.39 
 
 		 506 aa  870    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000132488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2420  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.19 
 
 		 506 aa  867    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0671416  hitchhiker  0.00255163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1601  chemotaxis sensory transducer  70.68 
 
 		 500 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.78336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1954  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.63 
 
 		 504 aa  704    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1807  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 505 aa  1019    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 505 aa  1019    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  96.24 
 
 		 505 aa  984    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.149959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2599  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.85 
 
 		 501 aa  665    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000558383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.16 
 
 		 499 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003409  methyl-accepting chemotaxis protein  40.87 
 
 		 467 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000050033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02368  hypothetical protein  40.28 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4500  methyl-accepting chemotaxis protein  40.04 
 
 		 467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 482 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.587548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 		 484 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.234847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.15 
 
 		 484 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19262  hitchhiker  0.00019204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 		 484 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000872044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 		 484 aa  299  9e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0806929  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  38.03 
 
 		 480 aa  293  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 		 484 aa  292  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.21 
 
 		 484 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1442  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 482 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.72 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00569391  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3852  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 		 467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0713  methyl-accepting chemotaxis protein  37.58 
 
 		 473 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.01 
 
 		 482 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2140  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 		 479 aa  282  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56843  normal  0.473301 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  47.2 
 
 		 476 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.28 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.22 
 
 		 481 aa  276  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  37.55 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0643  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000131612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 		 481 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0481837  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0868  methyl-accepting chemotaxis protein  39.71 
 
 		 536 aa  209  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000231989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 		 533 aa  207  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 		 533 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.24 
 
 		 533 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 		 634 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0410  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 		 538 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  38.29 
 
 		 634 aa  199  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  36.49 
 
 		 559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.94 
 
 		 634 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.75 
 
 		 533 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  38 
 
 		 629 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  38.7 
 
 		 640 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 		 713 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 637 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  38.57 
 
 		 712 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 		 640 aa  194  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  37.5 
 
 		 629 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  40.34 
 
 		 623 aa  193  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 		 638 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 		 638 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  38.37 
 
 		 712 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  34 
 
 		 629 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.13 
 
 		 638 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.23 
 
 		 637 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  34 
 
 		 629 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 		 640 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.61 
 
 		 639 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  36.86 
 
 		 629 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.86 
 
 		 640 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 		 716 aa  189  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 		 638 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  37.18 
 
 		 632 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.82 
 
 		 626 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 		 548 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.15 
 
 		 539 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 		 541 aa  187  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  37.15 
 
 		 539 aa  187  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  40.7 
 
 		 623 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.82 
 
 		 628 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  40.72 
 
 		 652 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  36.86 
 
 		 632 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.69 
 
 		 622 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  37.82 
 
 		 643 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.82 
 
 		 628 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 830 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.81 
 
 		 636 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.16 
 
 		 622 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.67 
 
 		 624 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.37 
 
 		 572 aa  183  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.38 
 
 		 560 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 		 625 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  37.71 
 
 		 653 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  34.44 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.62 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 		 525 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 		 624 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 		 527 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.64 
 
 		 570 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>