More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1659 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  100 
 
 		 626 aa  1287    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  48.87 
 
 		 630 aa  566  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  57.35 
 
 		 667 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  51.71 
 
 		 668 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  50.81 
 
 		 650 aa  556  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  49.23 
 
 		 676 aa  549  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  47.91 
 
 		 624 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  49.3 
 
 		 653 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  48.85 
 
 		 709 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  47.59 
 
 		 610 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  49.37 
 
 		 704 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  51.33 
 
 		 673 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  49.1 
 
 		 709 aa  531  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 		 581 aa  525  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  50.37 
 
 		 761 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  52.45 
 
 		 766 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 		 715 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  53.17 
 
 		 736 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  47.82 
 
 		 579 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  45.41 
 
 		 565 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  42.37 
 
 		 534 aa  333  6e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  34.99 
 
 		 574 aa  236  7e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  22.38 
 
 		 654 aa  75.1  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  27.3 
 
 		 459 aa  73.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 		 575 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  23.49 
 
 		 522 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  25.97 
 
 		 609 aa  64.3  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.86 
 
 		 1891 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  24.14 
 
 		 544 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  32.64 
 
 		 426 aa  62  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.71 
 
 		 561 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  20.22 
 
 		 1401 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 		 441 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  27.33 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  29.28 
 
 		 464 aa  62  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  24.12 
 
 		 758 aa  60.8  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  21.89 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  26.74 
 
 		 544 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  25.27 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  25.48 
 
 		 511 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  24.18 
 
 		 1847 aa  58.9  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  24.78 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  25.41 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  26.96 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  25.85 
 
 		 640 aa  58.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.18 
 
 		 2068 aa  58.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  29.94 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.78 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  25.49 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  23.43 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  29.94 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  21.14 
 
 		 586 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  31.51 
 
 		 568 aa  57  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  31.64 
 
 		 572 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  30.85 
 
 		 433 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  30.85 
 
 		 433 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  43.14 
 
 		 483 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 		 542 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  19.86 
 
 		 1401 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  34.85 
 
 		 1146 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 		 499 aa  56.2  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 1151 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  24.49 
 
 		 565 aa  56.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  30.85 
 
 		 433 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  30.95 
 
 		 434 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  23.05 
 
 		 563 aa  55.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  23.43 
 
 		 493 aa  55.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 566 aa  55.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  31.82 
 
 		 604 aa  55.1  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  28.09 
 
 		 442 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  26.09 
 
 		 586 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  45.45 
 
 		 434 aa  54.7  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  31.82 
 
 		 671 aa  54.7  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  21.99 
 
 		 610 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  29.85 
 
 		 426 aa  54.3  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  28.02 
 
 		 481 aa  54.3  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  34.29 
 
 		 1131 aa  54.3  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  25.52 
 
 		 570 aa  54.3  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  31.9 
 
 		 663 aa  53.9  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  28.19 
 
 		 463 aa  53.9  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  29.63 
 
 		 674 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  30.83 
 
 		 553 aa  53.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1294  alpha amylase, catalytic domain protein  23.71 
 
 		 566 aa  53.5  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  29.55 
 
 		 734 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  30.99 
 
 		 728 aa  53.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  22.62 
 
 		 586 aa  53.9  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  36.07 
 
 		 1133 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  36 
 
 		 1130 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 586 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  36.07 
 
 		 1136 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  22.41 
 
 		 556 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  28.19 
 
 		 468 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  25.81 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  29.55 
 
 		 715 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  24.91 
 
 		 533 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  25.99 
 
 		 1074 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  31.58 
 
 		 724 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 485 aa  52.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  23.81 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  32.79 
 
 		 1075 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>