231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0527 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  100 
 
 		 517 aa  1040    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  45.26 
 
 		 829 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  42.76 
 
 		 680 aa  368  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  38.57 
 
 		 779 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  38.78 
 
 		 782 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  38.78 
 
 		 782 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  38.78 
 
 		 782 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  42.38 
 
 		 734 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  41.53 
 
 		 438 aa  350  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  40.92 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  37.63 
 
 		 782 aa  334  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  41.46 
 
 		 764 aa  329  8e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  40.47 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  41.51 
 
 		 639 aa  326  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  39.96 
 
 		 738 aa  325  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  38.39 
 
 		 747 aa  295  9e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  39.39 
 
 		 759 aa  293  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  37.23 
 
 		 761 aa  281  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  34.87 
 
 		 493 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  33.65 
 
 		 485 aa  216  8e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  32.71 
 
 		 472 aa  206  6e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  31.51 
 
 		 614 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  32.03 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  29.81 
 
 		 659 aa  179  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  31.75 
 
 		 669 aa  176  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  29.74 
 
 		 646 aa  171  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  33.18 
 
 		 442 aa  170  7e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  34.14 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  30.23 
 
 		 691 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  29.72 
 
 		 653 aa  167  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  32.01 
 
 		 422 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  28.43 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  31.78 
 
 		 447 aa  153  8e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  31.78 
 
 		 447 aa  153  8e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  32.02 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  27.61 
 
 		 439 aa  146  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  31.03 
 
 		 661 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  28.45 
 
 		 628 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  41.96 
 
 		 130 aa  100  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  25.45 
 
 		 740 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  23.36 
 
 		 735 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  25 
 
 		 952 aa  73.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.78 
 
 		 732 aa  73.6  0.000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  23.34 
 
 		 738 aa  72.8  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  22.62 
 
 		 1034 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  24.88 
 
 		 739 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  24.56 
 
 		 952 aa  70.5  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  23.33 
 
 		 985 aa  70.1  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  25.12 
 
 		 974 aa  69.7  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  23.75 
 
 		 976 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  23.75 
 
 		 976 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  24.19 
 
 		 1039 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  23.38 
 
 		 998 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  22.36 
 
 		 1579 aa  68.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  26.46 
 
 		 744 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  21.9 
 
 		 736 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0438  helicase, putative  24.38 
 
 		 914 aa  67  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.17 
 
 		 744 aa  66.2  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  23.31 
 
 		 982 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  24.24 
 
 		 747 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  22.66 
 
 		 968 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  22.6 
 
 		 742 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  24.17 
 
 		 749 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  24.44 
 
 		 726 aa  63.9  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  24.63 
 
 		 1034 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2644  helicase, putative  25.06 
 
 		 902 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  23.69 
 
 		 737 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  24.17 
 
 		 736 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  23.18 
 
 		 740 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  25.57 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  22.37 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02880  hypothetical protein  24.82 
 
 		 914 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  22 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  25.23 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  23.56 
 
 		 738 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  24.42 
 
 		 741 aa  60.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  22.86 
 
 		 731 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  25 
 
 		 750 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  24.11 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.34 
 
 		 746 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  24.41 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  22.17 
 
 		 768 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  25.33 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0652  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.63 
 
 		 610 aa  58.9  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.955738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1405  Exodeoxyribonuclease V  26.25 
 
 		 1214 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  21.41 
 
 		 1000 aa  58.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  21.41 
 
 		 1000 aa  58.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  24.17 
 
 		 733 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  25.11 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  24.88 
 
 		 719 aa  57.4  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  24.05 
 
 		 728 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  23.22 
 
 		 1123 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  21.55 
 
 		 711 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  23.36 
 
 		 641 aa  57  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  21.96 
 
 		 1245 aa  57  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  23.21 
 
 		 742 aa  57  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  22.45 
 
 		 998 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  22.92 
 
 		 746 aa  57  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  24.51 
 
 		 728 aa  57  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  24.88 
 
 		 733 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>