233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0438 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02880  hypothetical protein  60.31 
 
 		 914 aa  1139    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0763  helicase, putative  56.56 
 
 		 907 aa  1007    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.81938  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0438  helicase, putative  100 
 
 		 914 aa  1880    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0999  helicase, putative  46.9 
 
 		 896 aa  811    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2644  helicase, putative  68.97 
 
 		 902 aa  1299    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4969  helicase, putative  66.2 
 
 		 73 aa  103  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955104 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  27.31 
 
 		 736 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  24.77 
 
 		 739 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  25.72 
 
 		 744 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  26.62 
 
 		 744 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  24.47 
 
 		 762 aa  75.1  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  25.86 
 
 		 738 aa  74.7  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  23.06 
 
 		 742 aa  74.7  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  26.16 
 
 		 659 aa  74.3  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.83 
 
 		 744 aa  73.9  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  26.68 
 
 		 727 aa  74.3  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  24.76 
 
 		 754 aa  72.8  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  24.89 
 
 		 736 aa  70.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  23.61 
 
 		 740 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  25.66 
 
 		 741 aa  70.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  25.16 
 
 		 736 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  24.67 
 
 		 746 aa  68.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  24.21 
 
 		 680 aa  68.9  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  23.87 
 
 		 742 aa  68.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  24.02 
 
 		 738 aa  68.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  24.01 
 
 		 725 aa  67.8  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  22.83 
 
 		 728 aa  67.4  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  23.99 
 
 		 728 aa  67.4  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  25.51 
 
 		 728 aa  66.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  24.28 
 
 		 738 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  24.04 
 
 		 750 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  27.14 
 
 		 731 aa  66.6  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  25.66 
 
 		 731 aa  67  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  24.12 
 
 		 517 aa  65.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  25.35 
 
 		 733 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  25.35 
 
 		 733 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  27.08 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.32 
 
 		 825 aa  64.7  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  24.2 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  24.53 
 
 		 724 aa  63.9  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  26.82 
 
 		 373 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  27.84 
 
 		 834 aa  63.9  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  25.12 
 
 		 732 aa  63.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  25.71 
 
 		 776 aa  63.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  23.42 
 
 		 653 aa  63.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  25.51 
 
 		 710 aa  63.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  25.7 
 
 		 733 aa  62.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  27.2 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  25.24 
 
 		 724 aa  62  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  23.62 
 
 		 747 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  23.63 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  25.6 
 
 		 637 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  23.83 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  24.89 
 
 		 749 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0897  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.49 
 
 		 580 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  25.82 
 
 		 372 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0914  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.49 
 
 		 580 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1208  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.09 
 
 		 551 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  25.13 
 
 		 747 aa  60.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  26.7 
 
 		 806 aa  60.1  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  23.98 
 
 		 768 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  25.8 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  24.47 
 
 		 641 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0903  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.49 
 
 		 580 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  26.2 
 
 		 749 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1432  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.11 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00407883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0253  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.56 
 
 		 584 aa  59.3  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  22.34 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  23.44 
 
 		 727 aa  59.3  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  24.55 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  25.38 
 
 		 735 aa  58.9  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  24.11 
 
 		 742 aa  58.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  25.48 
 
 		 825 aa  58.5  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  25.48 
 
 		 825 aa  58.5  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  24.21 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  23.09 
 
 		 745 aa  58.2  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  22.59 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0594  exodeoxyribonuclease V  24.13 
 
 		 369 aa  57  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  22.63 
 
 		 726 aa  57.4  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  24.93 
 
 		 731 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0686  exodeoxyribonuclease V  24.26 
 
 		 369 aa  57.4  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  24.88 
 
 		 772 aa  57.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10640  exonuclease V alpha subunit recD  23.66 
 
 		 575 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.47997e-19  normal  0.376997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2294  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.71 
 
 		 598 aa  57  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  23.44 
 
 		 711 aa  57  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  23.2 
 
 		 735 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5131  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.09 
 
 		 555 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0998  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.33 
 
 		 586 aa  55.8  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4627  RecD/TraA family helicase  27.27 
 
 		 871 aa  56.2  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0750551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  24.66 
 
 		 722 aa  55.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1466  exodeoxyribonuclease V  25.74 
 
 		 369 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0955  exodeoxyribonuclease V  25.3 
 
 		 369 aa  55.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  24.42 
 
 		 375 aa  55.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1955 aa  55.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0770  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  20.86 
 
 		 579 aa  55.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0335755  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1281  deoxyribonuclease  25.92 
 
 		 369 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  26.63 
 
 		 367 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  24.38 
 
 		 728 aa  55.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  25.37 
 
 		 369 aa  54.7  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  24.22 
 
 		 740 aa  54.7  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>