243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0999 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0763  helicase, putative  48.44 
 
 		 907 aa  830    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.81938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2644  helicase, putative  46.3 
 
 		 902 aa  789    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02880  hypothetical protein  44.8 
 
 		 914 aa  771    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0999  helicase, putative  100 
 
 		 896 aa  1858    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0438  helicase, putative  46.79 
 
 		 914 aa  800    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  24.36 
 
 		 750 aa  72.4  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  23.67 
 
 		 736 aa  70.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.62 
 
 		 744 aa  70.5  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  25 
 
 		 747 aa  70.1  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  24.31 
 
 		 659 aa  70.1  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  25.75 
 
 		 762 aa  69.3  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  25.12 
 
 		 744 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  26.54 
 
 		 834 aa  67.8  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  24.65 
 
 		 768 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  25.81 
 
 		 806 aa  66.6  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  23.29 
 
 		 745 aa  65.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  23.57 
 
 		 742 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  25.26 
 
 		 736 aa  65.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  25.66 
 
 		 710 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  23.33 
 
 		 741 aa  65.1  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  24 
 
 		 744 aa  64.7  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  24.3 
 
 		 736 aa  64.7  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  23.96 
 
 		 739 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  25.45 
 
 		 731 aa  63.9  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  25.92 
 
 		 742 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  24.82 
 
 		 741 aa  62  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  25.12 
 
 		 732 aa  61.6  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  24.22 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  24.2 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  23.62 
 
 		 688 aa  61.2  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  25.19 
 
 		 731 aa  60.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  22.91 
 
 		 1098 aa  60.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  24.13 
 
 		 750 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.33 
 
 		 833 aa  59.3  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  22.77 
 
 		 742 aa  59.3  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2767  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.7 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.57 
 
 		 825 aa  58.9  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.44 
 
 		 1245 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  23.36 
 
 		 725 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  23.6 
 
 		 653 aa  57.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  25.19 
 
 		 733 aa  57  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  21.92 
 
 		 637 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  24.48 
 
 		 724 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  24.52 
 
 		 974 aa  56.6  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  21.83 
 
 		 733 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0253  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.65 
 
 		 584 aa  56.6  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  26.11 
 
 		 749 aa  56.2  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  24.52 
 
 		 792 aa  56.2  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  23.33 
 
 		 776 aa  55.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  22.81 
 
 		 1538 aa  55.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  23.23 
 
 		 727 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  23.49 
 
 		 772 aa  55.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  23.23 
 
 		 738 aa  55.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  28.93 
 
 		 929 aa  55.1  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  23.02 
 
 		 728 aa  54.7  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  23.02 
 
 		 680 aa  54.7  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  21.57 
 
 		 733 aa  54.7  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  23.43 
 
 		 1095 aa  54.3  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2294  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.38 
 
 		 598 aa  53.9  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2430  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.38 
 
 		 647 aa  54.3  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869931  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5408  helicase, RecD/TraA family  20.76 
 
 		 741 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.68949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  22 
 
 		 754 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0915  exonuclease V subunit alpha  38.33 
 
 		 619 aa  54.3  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.718919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  24.82 
 
 		 738 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  29.41 
 
 		 814 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0323  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.88 
 
 		 599 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  23.1 
 
 		 740 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0578  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.33 
 
 		 601 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0343  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.88 
 
 		 599 aa  52.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  21.72 
 
 		 1098 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1211  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.43 
 
 		 787 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  24.43 
 
 		 722 aa  52.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  25.06 
 
 		 746 aa  52.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  20.6 
 
 		 726 aa  52.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  24.69 
 
 		 375 aa  52.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  28.28 
 
 		 1014 aa  52.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1208  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  20.56 
 
 		 551 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0903  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  21.76 
 
 		 580 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3388  exonuclease V subunit alpha  36.67 
 
 		 618 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002686  exodeoxyribonuclease V alpha chain  38.57 
 
 		 715 aa  52.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  25.48 
 
 		 726 aa  52.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.05 
 
 		 1105 aa  52.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  26.7 
 
 		 1107 aa  52  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0897  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  21.76 
 
 		 580 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  30.94 
 
 		 1010 aa  52.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0914  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  21.76 
 
 		 580 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1292  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.88 
 
 		 731 aa  52  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.255394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  35.09 
 
 		 1955 aa  52  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  28.31 
 
 		 879 aa  51.6  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.61 
 
 		 2007 aa  51.6  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0371  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.41 
 
 		 588 aa  51.6  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.219276  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  22.06 
 
 		 740 aa  51.6  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1099  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.61 
 
 		 773 aa  51.2  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.774754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4324  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.63 
 
 		 767 aa  51.2  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1216  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.63 
 
 		 772 aa  51.2  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1189  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.63 
 
 		 773 aa  51.2  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357914  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  29.53 
 
 		 1557 aa  51.2  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0998  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  40 
 
 		 586 aa  50.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03300  hypothetical protein  37.14 
 
 		 725 aa  50.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1099  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30 
 
 		 774 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>