More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0652 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0652  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  100 
 
 
610 aa  1177    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.955738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0323  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.07 
 
 
599 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1056  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.44 
 
 
609 aa  194  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.923429  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1432  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.9 
 
 
576 aa  193  8e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00407883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0343  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.22 
 
 
599 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0578  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.92 
 
 
601 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2933  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.05 
 
 
646 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2548  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.05 
 
 
650 aa  180  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.975526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2150  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.68 
 
 
604 aa  177  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00157683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5137  Exodeoxyribonuclease V  26.68 
 
 
749 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34484  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1126  exonuclease V, alpha subunit  30.72 
 
 
734 aa  172  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00308131  normal  0.011484 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1892  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.72 
 
 
594 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087164  hitchhiker  0.00000000000433292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1535  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.65 
 
 
595 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  29.03 
 
 
750 aa  170  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  29.9 
 
 
574 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1847  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.48 
 
 
683 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.401727  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3006  exonuclease V subunit alpha  25.81 
 
 
616 aa  165  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1292  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.45 
 
 
731 aa  165  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.255394  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1211  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.07 
 
 
787 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53406  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1358  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.17 
 
 
588 aa  161  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01029  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.64 
 
 
731 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.539328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4567  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.59 
 
 
708 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  26.34 
 
 
728 aa  161  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3813  exonuclease V subunit alpha  26.76 
 
 
621 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.752384  hitchhiker  0.00686322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2294  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.11 
 
 
598 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1400  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.38 
 
 
581 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  26.4 
 
 
744 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3262  exonuclease V subunit alpha  27.41 
 
 
607 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1778  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.82 
 
 
739 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000685942 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1460  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.18 
 
 
698 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0998  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.51 
 
 
586 aa  157  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0770  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.13 
 
 
579 aa  157  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0335755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0915  exonuclease V subunit alpha  26.39 
 
 
619 aa  157  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.718919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  26.68 
 
 
735 aa  156  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  28.33 
 
 
727 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  29 
 
 
733 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  29.23 
 
 
733 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0903  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.67 
 
 
580 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0897  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.67 
 
 
580 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0914  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.67 
 
 
580 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3205  exonuclease V subunit alpha  26.94 
 
 
611 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3156  exonuclease V subunit alpha  26.94 
 
 
611 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3139  exonuclease V subunit alpha  26.94 
 
 
611 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3219  exonuclease V subunit alpha  26.94 
 
 
611 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3319  exonuclease V subunit alpha  26.94 
 
 
611 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.940485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5131  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.09 
 
 
555 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3374  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.46 
 
 
616 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3388  exonuclease V subunit alpha  26.39 
 
 
618 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  30.23 
 
 
688 aa  151  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25 
 
 
526 aa  151  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1170  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.32 
 
 
655 aa  152  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1987  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.05 
 
 
676 aa  151  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000228018  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55660  exodeoxyribonuclease V alpha chain  24.46 
 
 
721 aa  150  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866156  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2745  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.2 
 
 
641 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  25.7 
 
 
576 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3231  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.67 
 
 
639 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00025834  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4084  exonuclease V subunit alpha  25.78 
 
 
608 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0992  exonuclease V subunit alpha  26.42 
 
 
657 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2169  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.7 
 
 
601 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613998  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3230  exonuclease V subunit alpha  26.24 
 
 
652 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.91996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4850  exodeoxyribonuclease V alpha chain  24.14 
 
 
720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.61173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0253  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.1 
 
 
584 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02667  exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain  25.78 
 
 
608 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0872  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.78 
 
 
608 aa  148  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.938405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3139  exonuclease V subunit alpha  25.78 
 
 
608 aa  148  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3043  exonuclease V subunit alpha  25.78 
 
 
608 aa  148  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.225396  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1044  exonuclease V subunit alpha  26.17 
 
 
657 aa  148  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0896  exonuclease V subunit alpha  25.78 
 
 
608 aa  148  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367719  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02628  hypothetical protein  25.78 
 
 
608 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.627808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0692  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.7 
 
 
603 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10640  exonuclease V alpha subunit recD  26.65 
 
 
575 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.47997e-19  normal  0.376997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0371  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.57 
 
 
588 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.219276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1208  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.42 
 
 
551 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2965  exonuclease V subunit alpha  25.54 
 
 
608 aa  147  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  26.14 
 
 
741 aa  147  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  25.54 
 
 
736 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  28.87 
 
 
728 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  28.14 
 
 
733 aa  146  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2966  exonuclease V subunit alpha  25.54 
 
 
608 aa  146  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  27.54 
 
 
742 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  27.69 
 
 
750 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  28.09 
 
 
739 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  27.16 
 
 
742 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1980  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.5 
 
 
714 aa  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  25.57 
 
 
659 aa  145  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  24.39 
 
 
731 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0646  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.46 
 
 
573 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.547153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4013  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.16 
 
 
626 aa  144  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  26.45 
 
 
727 aa  143  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  26.53 
 
 
744 aa  143  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0682  exodeoxyribonuclease V alpha chain  27.08 
 
 
674 aa  143  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163912  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  26.41 
 
 
772 aa  143  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  26.71 
 
 
746 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  23.36 
 
 
530 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1812  exodeoxyribonuclease V  24.46 
 
 
639 aa  143  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1744  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.46 
 
 
639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  27.45 
 
 
728 aa  141  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0522  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.59 
 
 
735 aa  140  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.496827  hitchhiker  0.000245551 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14781  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  28.88 
 
 
573 aa  140  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.922098  normal  0.231202 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  23.56 
 
 
731 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>