130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3191 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  100 
 
 		 179 aa  348  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.58 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.16 
 
 		 163 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.19 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.65 
 
 		 204 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.65 
 
 		 204 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.86 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.89 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  33.13 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  40.91 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  34.51 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  34.48 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  33.09 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.4 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  35.56 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  40.59 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  34.97 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  30.43 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.28 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  29.03 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.85 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  41.25 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.08 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  26.54 
 
 		 338 aa  55.5  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.23 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  34.25 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  29.55 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  33.88 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.08 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  33.88 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  33.88 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.54 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.08 
 
 		 160 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  38.24 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  28.78 
 
 		 149 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.89 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  28.23 
 
 		 311 aa  48.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.01 
 
 		 159 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  28.72 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.52 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.67 
 
 		 356 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  40 
 
 		 155 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.01 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  31.67 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  34.34 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 		 389 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  37.18 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  37.7 
 
 		 114 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.26 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 127 aa  45.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  29.01 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  25.86 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  29.59 
 
 		 136 aa  44.7  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  33.71 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  30.85 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  31.43 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  32.71 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  32.71 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  38.71 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  32.47 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.12 
 
 		 377 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0281  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.15 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  36.36 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 421 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>