More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2509 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2509  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 865 aa  1707    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  38.1 
 
 		 2911 aa  97.8  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  43.02 
 
 		 1424 aa  97.4  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  41.85 
 
 		 2667 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  40.85 
 
 		 745 aa  95.1  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  38.8 
 
 		 534 aa  93.2  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  38.29 
 
 		 1712 aa  91.3  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.22 
 
 		 1236 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 1079 aa  89  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  42.42 
 
 		 648 aa  88.6  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.98 
 
 		 2678 aa  88.6  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  43.9 
 
 		 946 aa  88.2  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  40.49 
 
 		 709 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  38.02 
 
 		 820 aa  87.4  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  40.61 
 
 		 3954 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.15 
 
 		 2775 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  39.01 
 
 		 3209 aa  85.9  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.71 
 
 		 1180 aa  85.9  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  35.38 
 
 		 1164 aa  84  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  39.89 
 
 		 4687 aa  83.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  37.43 
 
 		 260 aa  83.2  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  41.4 
 
 		 206 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.66 
 
 		 3619 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  39.06 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  43.59 
 
 		 677 aa  82.8  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  39.06 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  39.11 
 
 		 3608 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  39.11 
 
 		 3619 aa  82  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  38.14 
 
 		 795 aa  82  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  35.11 
 
 		 639 aa  81.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4947  hypothetical protein  34.48 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  39.46 
 
 		 1855 aa  81.3  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  39.05 
 
 		 938 aa  80.9  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.87 
 
 		 588 aa  80.9  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.43 
 
 		 1963 aa  80.9  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  37.81 
 
 		 4800 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  33.5 
 
 		 475 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.29 
 
 		 1795 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  39.2 
 
 		 2105 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  40.96 
 
 		 2954 aa  78.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  39.55 
 
 		 556 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  35.75 
 
 		 813 aa  77.8  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  41.07 
 
 		 2836 aa  77  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3067  hypothetical protein  48.65 
 
 		 405 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.65 
 
 		 980 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  40.7 
 
 		 686 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  37.58 
 
 		 232 aa  76.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  36.93 
 
 		 950 aa  75.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  43.04 
 
 		 1145 aa  76.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.2 
 
 		 3427 aa  75.5  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  36.53 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  36.53 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  31.94 
 
 		 3026 aa  75.1  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  38.65 
 
 		 1864 aa  74.7  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.41 
 
 		 1197 aa  74.3  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  40.1 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  39.51 
 
 		 2887 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.64 
 
 		 1279 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  36.55 
 
 		 833 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  32.35 
 
 		 375 aa  73.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  43.45 
 
 		 759 aa  72.8  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  35.56 
 
 		 1582 aa  72.4  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  36.54 
 
 		 742 aa  72.4  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  36.98 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  36.24 
 
 		 1213 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  32.35 
 
 		 3587 aa  72.4  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  32.88 
 
 		 574 aa  71.6  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.11 
 
 		 1019 aa  71.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  32.86 
 
 		 1072 aa  71.6  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  34.42 
 
 		 1895 aa  71.2  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  31.14 
 
 		 1534 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  33.79 
 
 		 1400 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35 
 
 		 4334 aa  71.2  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0833  hemolysin-type calcium-binding region  29.79 
 
 		 571 aa  70.5  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  33.33 
 
 		 856 aa  70.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  42.17 
 
 		 757 aa  70.5  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  38.18 
 
 		 833 aa  70.5  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  34.3 
 
 		 243 aa  70.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  36.63 
 
 		 2198 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  39.1 
 
 		 1037 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  31.22 
 
 		 3587 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.2 
 
 		 421 aa  70.1  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  35.88 
 
 		 724 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  36.32 
 
 		 245 aa  69.3  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  34.76 
 
 		 867 aa  69.3  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  33.5 
 
 		 2145 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  32.93 
 
 		 982 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  37.5 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  36.31 
 
 		 615 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  34.3 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  32.83 
 
 		 1544 aa  68.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  45.76 
 
 		 1390 aa  68.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  37.74 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  35.76 
 
 		 744 aa  68.6  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  38.58 
 
 		 1971 aa  68.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  38.18 
 
 		 2097 aa  68.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  32.86 
 
 		 1287 aa  67.8  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  36.61 
 
 		 1055 aa  67.8  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>