More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3465 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
419 aa  816    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4791  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.84 
 
 
434 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 
434 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3907  chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 
424 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 
562 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1394  chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 
444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.2 
 
 
675 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  45.3 
 
 
565 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
441 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.86 
 
 
567 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.01 
 
 
566 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 
563 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.83 
 
 
563 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.18 
 
 
561 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.1 
 
 
563 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.77 
 
 
563 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4661  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.13 
 
 
440 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.68 
 
 
689 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  46.01 
 
 
565 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1414  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 
440 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0801097  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.42 
 
 
567 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.79 
 
 
561 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  45.26 
 
 
714 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 
674 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.99 
 
 
573 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  42.81 
 
 
656 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.99 
 
 
730 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 
563 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  43.01 
 
 
656 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  45.77 
 
 
561 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.72 
 
 
670 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.37 
 
 
563 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.81 
 
 
563 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  46.44 
 
 
691 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.07 
 
 
730 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1802  chemotaxis sensory transducer  45.9 
 
 
438 aa  200  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.04 
 
 
688 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.21 
 
 
673 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.86 
 
 
688 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 
566 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 
656 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.48 
 
 
716 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.15 
 
 
542 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 
691 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
731 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 
563 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  46.79 
 
 
688 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  46.76 
 
 
565 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
563 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  45.68 
 
 
688 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  41.88 
 
 
566 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 
563 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 
674 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
672 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.9 
 
 
691 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.04 
 
 
561 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 
577 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.84 
 
 
655 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  45.66 
 
 
561 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  48.86 
 
 
561 aa  193  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.86 
 
 
561 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
568 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  48.11 
 
 
676 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
563 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.11 
 
 
568 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
563 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
562 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  40.94 
 
 
688 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 
564 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  46.79 
 
 
563 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  45.61 
 
 
707 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.99 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  44.65 
 
 
565 aa  190  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.95 
 
 
698 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  43.26 
 
 
697 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  49.81 
 
 
561 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.32 
 
 
440 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178259  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.88 
 
 
587 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
741 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0530  methyl-accepting chemotaxis protein  44.32 
 
 
569 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667624  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.56 
 
 
698 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.32 
 
 
667 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  44.25 
 
 
566 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.65 
 
 
561 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.14 
 
 
686 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.62 
 
 
562 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.69 
 
 
562 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3241  chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
445 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.768967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.96 
 
 
449 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  49.62 
 
 
562 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  43.57 
 
 
561 aa  186  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.83 
 
 
562 aa  186  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.14 
 
 
712 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  45.42 
 
 
563 aa  186  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  39.89 
 
 
562 aa  186  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.07 
 
 
681 aa  186  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.21 
 
 
560 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.42 
 
 
572 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.3 
 
 
681 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>