More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0099 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  100 
 
 		 663 aa  1316    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  55.29 
 
 		 521 aa  306  6e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  39.9 
 
 		 705 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  47.75 
 
 		 840 aa  290  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  45.21 
 
 		 670 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  45.21 
 
 		 667 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  51.74 
 
 		 378 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  49.81 
 
 		 393 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  44.41 
 
 		 967 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  44.41 
 
 		 967 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  49.81 
 
 		 393 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  44.13 
 
 		 817 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  44.13 
 
 		 817 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  42.77 
 
 		 682 aa  257  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  40.94 
 
 		 786 aa  239  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  40.37 
 
 		 785 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  42.5 
 
 		 786 aa  228  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2571  protein serine/threonine phosphatase  43.15 
 
 		 251 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  29.11 
 
 		 543 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.55 
 
 		 572 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.85 
 
 		 957 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  30.3 
 
 		 404 aa  112  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.88 
 
 		 1332 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  27.3 
 
 		 649 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  28.07 
 
 		 633 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.03 
 
 		 961 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  30.32 
 
 		 631 aa  107  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0917  serine phosphatase  27.46 
 
 		 630 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  31.2 
 
 		 630 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  31.2 
 
 		 630 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  30.68 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.48 
 
 		 1004 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.1 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  25.95 
 
 		 649 aa  104  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  28.63 
 
 		 642 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.79 
 
 		 563 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.25 
 
 		 995 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  28.63 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  28.96 
 
 		 381 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  29.27 
 
 		 687 aa  101  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.41 
 
 		 1480 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  26.4 
 
 		 521 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  31.37 
 
 		 775 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  27.4 
 
 		 445 aa  98.2  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  26.26 
 
 		 637 aa  97.8  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  24.68 
 
 		 644 aa  97.1  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.8 
 
 		 1017 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  29.48 
 
 		 630 aa  96.3  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.23 
 
 		 1087 aa  95.9  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.85 
 
 		 516 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  27.96 
 
 		 413 aa  95.5  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  27.4 
 
 		 708 aa  95.5  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  29.6 
 
 		 885 aa  94.4  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.14 
 
 		 997 aa  94  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  26.43 
 
 		 445 aa  93.6  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  27.82 
 
 		 706 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  32.41 
 
 		 671 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0020  stage II sporulation E family protein  32.06 
 
 		 464 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  31.05 
 
 		 846 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  30.4 
 
 		 366 aa  92.8  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  32.25 
 
 		 612 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  28.02 
 
 		 1100 aa  91.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.8 
 
 		 388 aa  91.3  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  31.35 
 
 		 364 aa  91.3  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  30.83 
 
 		 443 aa  90.9  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  29.13 
 
 		 694 aa  90.5  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  30.15 
 
 		 463 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  26.85 
 
 		 536 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.21 
 
 		 482 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  29 
 
 		 474 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  32.23 
 
 		 377 aa  89.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  30.15 
 
 		 460 aa  88.6  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  28.67 
 
 		 723 aa  89  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.64 
 
 		 396 aa  88.6  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  30.08 
 
 		 467 aa  88.2  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  27.17 
 
 		 637 aa  88.6  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  28.83 
 
 		 477 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  26.52 
 
 		 643 aa  87.8  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  26.01 
 
 		 705 aa  88.2  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  28.08 
 
 		 1087 aa  87.8  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  29.96 
 
 		 455 aa  87  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  30.63 
 
 		 708 aa  87  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  25.87 
 
 		 423 aa  87  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.19 
 
 		 590 aa  86.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  27.13 
 
 		 410 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  25.79 
 
 		 705 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  32.03 
 
 		 535 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  27.34 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.4 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  29.44 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  30.23 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  30.61 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  26.04 
 
 		 648 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  26.43 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  26.8 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  24.54 
 
 		 678 aa  84.7  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  28.09 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  28.3 
 
 		 693 aa  84.3  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  28.09 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  29.37 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>