82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1929 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1929  two component regulator propeller domain protein  100 
 
 		 775 aa  1529    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00113538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0461  two component regulator propeller domain protein  28.5 
 
 		 765 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0707  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  25.16 
 
 		 760 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5163  two component regulator propeller domain protein  28.66 
 
 		 774 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522129 
 
 
-
 
NC_002950  PG1604  immunoreactive 84 kDa antigen PG93  25.85 
 
 		 776 aa  191  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3302  surface antigen  23.44 
 
 		 756 aa  187  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.939122 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02505  immunoreactive 84 kDa antigen  25.94 
 
 		 761 aa  176  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4547  hypothetical protein  33.6 
 
 		 608 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  22.1 
 
 		 1397 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  25.68 
 
 		 1355 aa  68.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  23.24 
 
 		 1017 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  25.21 
 
 		 1017 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  22.57 
 
 		 1070 aa  61.6  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  27.3 
 
 		 1278 aa  61.6  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 1242 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  21.76 
 
 		 1105 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  25.42 
 
 		 1346 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  20.12 
 
 		 1374 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  25.27 
 
 		 1051 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 1453 aa  58.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  25.6 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  20.68 
 
 		 1034 aa  58.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  21.89 
 
 		 1054 aa  57.8  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  23.39 
 
 		 1070 aa  57  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  25.81 
 
 		 1084 aa  57.4  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  25 
 
 		 1008 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  24.27 
 
 		 1366 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  23.2 
 
 		 1250 aa  55.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  22.42 
 
 		 1414 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  24.28 
 
 		 1093 aa  54.3  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  22.62 
 
 		 1378 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  26.67 
 
 		 359 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  22.65 
 
 		 1404 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  27.41 
 
 		 316 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3298  sensory box protein  23.09 
 
 		 1494 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  21.07 
 
 		 1278 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  26.09 
 
 		 1378 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  23.65 
 
 		 1086 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  23.78 
 
 		 1407 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  26.82 
 
 		 316 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  21.33 
 
 		 1373 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  21.64 
 
 		 1118 aa  51.6  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  25 
 
 		 1370 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  22.27 
 
 		 1355 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 1211 aa  50.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.99 
 
 		 1079 aa  50.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  24.29 
 
 		 1388 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06201  Putative signal protein with GGDEF domain  23.31 
 
 		 973 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  20.36 
 
 		 1349 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  26.99 
 
 		 1004 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3380  GGDEF domain-containing protein  23.6 
 
 		 1479 aa  50.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00965  Putative signal protein with GGDEF domain  23.31 
 
 		 973 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.051643  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  23.18 
 
 		 1005 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  23.28 
 
 		 1526 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  21.59 
 
 		 975 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  27.46 
 
 		 1351 aa  49.7  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02697  sensory box protein  27.94 
 
 		 1510 aa  49.3  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 		 1237 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  22.16 
 
 		 1334 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  22.63 
 
 		 1316 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  19.9 
 
 		 1363 aa  48.5  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2243  hypothetical protein  23.37 
 
 		 846 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  28.95 
 
 		 386 aa  47.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  21.92 
 
 		 1114 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  26.87 
 
 		 1175 aa  47.8  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 		 1181 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  21.45 
 
 		 1374 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.35 
 
 		 1258 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  30.67 
 
 		 692 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0306  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.01 
 
 		 355 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.28 
 
 		 1486 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  25.85 
 
 		 1324 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  22.48 
 
 		 1384 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.99 
 
 		 1276 aa  46.6  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  23.61 
 
 		 1313 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  25 
 
 		 1347 aa  45.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  22.97 
 
 		 1024 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  25.17 
 
 		 1194 aa  44.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  26.6 
 
 		 976 aa  44.7  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  28.64 
 
 		 963 aa  44.3  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  22.96 
 
 		 1342 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5951  signal transduction histidine kinase, LytS  31.03 
 
 		 975 aa  44.3  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.580279  normal  0.0504112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>